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Hiperciclos con traducción: replicación acoplada y síntesis de polipéptidos
HYC-1979Lesson 6: Concentration, Hypercycles, Fixed
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Los hiperciclos acoplados a la traducción extienden el hiperciclo elemental al hacer que cada polinucleótido sea a la vez una plantilla de replicación y una plantilla de traducción. La misma molécula de ARN puede ser copiada por una replicasa y leída por un ribosoma, por lo que la replicación y la traducción compiten por la plantilla.

Hiperciclo con traducciónARNi es a la vez una plantilla de replicación y una plantilla de traducción: los dos procesos compiten por la misma moléculaARNi−1doble plantillaARNidoble plantillaARNi+1doble plantillaEi−1catalizadorEicatalizadorEi+1catalizadortraduccióntraduccióntraducciónreplicación catalizadareplicación catalizadaEi+1 cataliza la replicación del ARNi−1, cerrando el cicloDoble plantillaARNi se copiay se traduce→ compiten1TraducciónARNi → Ei2Formación del complejoEi + ARNi+1 ⇌ (ARNi+1·Ei)3Replicación catalizada(ARNi+1·Ei) → 2 ARNi+1 + Ei

Arquitectura molecular y cinética

  • Doble función de plantilla. Para el miembro i, el ARNi se copia para producir más ARNi y se traduce para producir el polipéptido . Ambos procesos recurren al mismo conjunto de ARN librei.
  • Cierre del ciclo. El polipéptido traducido a partir del miembro i cataliza la replicación de un miembro distinto, normalmente i+1. La organización es hipercíclica y no puramente autocatalítica porque no cataliza su propio ARN plantillai.
  • Especies acopladas. El estado cinético contiene explícitamente polinucleótidos libres, polipéptidos libres y complejos polinucleótido-polipéptido. Los complejos pueden ser las formas catalíticamente activas o activas para la replicación, por ejemplo ARNi+1·.
  • Arquitectura cinética. La replicación y la traducción dirigidas por plantilla están entrelazadas con la retroalimentación catalítica. La información de los polipéptidos se mantiene únicamente a través de las plantillas de polinucleótidos que la codifican; los polipéptidos no se replican de forma independiente.
  • Consecuencia a nivel de sistema. El hiperciclo acoplado a la traducción no puede reducirse a un hiperciclo catalítico simple porque añade pasos de traducción y de formación de complejos al ciclo de replicación. Estos pasos adicionales preparan el análisis posterior de los límites de concentración y la estabilidad.

Pasos cinéticos elementales

Para el miembro i del ciclo, un esquema compacto es:

  • Traducción: ARNi → ARNi + .
  • Formación del complejo: + ARNi+1 ⇌ (ARNi+1·).
  • Replicación catalizada: (ARNi+1·) → 2 ARNi+1 + , o + ARNi+1 → 2 ARNi+1 + si el complejo no se muestra de forma explícita.

La replicación del ARNi está catalizada por Ei−1. La iteración sobre i cierra el hiperciclo acoplado a la traducción. Dado que la replicación y la traducción comparten la misma plantilla de ARN, sus velocidades relativas determinan cuánto ARN se utiliza para la copia frente a cuánto polipéptido se pone a disposición como catalizador. Este acoplamiento es la diferencia estructural clave respecto a un hiperciclo elemental.

Objetivo de aprendizaje
Describir la estructura y los supuestos cinéticos de un hiperciclo con traducción, incluidos el acoplamiento polinucleótido-polipéptido y la formación de complejos.