Sel terintegrasi bukanlah titik awal kehidupan yang terpisah, melainkan titik akhir dari perluasan bertahap dan berkesinambungan dari pengorganisasian diri molekuler. Setiap tahap menyelesaikan masalah informasi, katalitik, atau parasit tertentu sementara seleksi Darwinian terus berlangsung pada tingkat molekuler.
- Tahap 1 β Bahan baku prebiotik: sintesis prebiotik menghasilkan asam amino dan polinukleotida dengan kelimpahan tak acak; bias komposisi seperti replikasi kaya GC membatasi replikator paling awal.
- Tahap 2 β Kuasi-spesies: mutasi dan seleksi menghasilkan populasi kuasi-spesies yang kandungan informasinya yang stabil dibatasi oleh ketepatan replikasi dan ambang kesalahan; qΜm, Οm dan vm memprediksi hilangnya atau terpeliharanya informasi.
- Tahap 3 β Integrasi siklus hiper: penggandengan katalitik, autokatalitik, dan siklus hiper menghubungkan replikator menjadi siklus kooperatif dengan pertumbuhan yang koheren; parasit, beban mutan, dan kegagalan nukleasi menentukan batas-batas organisasi siklus hiper.
- Tahap 4 β Translasi dan pengkodean primordial: Adaptor/pembawa pesan RNA, kerangka bebas koma, kodon GGC/GCC awal, dan transfer peptida tanpa ribosom memperluas siklus hiper menjadi polipeptida fungsional yang terkode.
- Tahap 5 β Kompartementasi: siklus hiper dan protosel yang terkompartementasi melokalkan replikasi dan translasi yang tergandeng, menekan eksploitasi parasit, dan menciptakan unit seleksi tingkat lebih tinggi dalam kondisi batas yang realistis.
- Tahap 6 β Unifikasi genom: berbagai replikator siklus hiper dikonsolidasikan menjadi genom terintegrasi; proofreading DNA, rekombinasi, dan ketepatan yang meningkat menggeser ambang kesalahan dan memungkinkan sel terintegrasi yang lebih besar.
Prinsip kesinambungan: transisi tersebut bukanlah titik awal yang terpisah, melainkan peningkatan berturut-turut dalam penutupan katalitik, kapasitas informasi, dan integrasi struktural; mode kegagalan seperti katastrofe kesalahan, eksploitasi parasit, dan kegagalan fungsi gabungan menandai batas yang harus diatasi oleh tahap-tahap berikutnya.
Sintesis formal dengan teori seleksi: analisis titik tetap dan Jacobian, siklus limit, bifurkasi Hopf, dan rezim penggandengan menjelaskan kapan integrasi stabil dan kapan integrasi tersebut runtuh. Mutagenesis fag QΞ² menggambarkan distribusi mutan dan ambang kesalahan, dan permainan evolusi kalimat menunjukkan bagaimana ketepatan membatasi informasi; proofreading dan rekombinasi DNA kemudian melonggarkan batas ini, membantu menjelaskan bagaimana genom terunifikasi dapat muncul dari siklus hiper RNA/protein sebelumnya.
Kesinambungan dari Polinukleotida ke Sel TerintegrasiTangga enam tahap dari kelimpahan prebiotik hingga genom terunifikasi, dengan sumbu vertikal menandai pertumbuhan kapasitas informasi, penutupan katalitik, dan integrasi struktural; keterangan menandai ambang kesalahan, tantangan parasit, kompartementasi, dan unifikasi genom.
