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Ipercicli Catalitici e Selezione Molecolare
HYC-1979Lesson 2: Catalytic, Which, System
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Questa lezione si apre con una domanda centrale per la teoria dell'origine della vita: come può un insieme di molecole autoreplicanti generare selezione molecolare senza un macchinario cellulare preesistente? La risposta sviluppata qui è l' iperciclo catalitico: un legame ciclico di unità autoreplicanti in cui la replicazione di ciascuna unità è cataliticamente sostenuta da un altro membro del ciclo. Il risultato è un'auto-organizzazione collettiva, non una collezione di replicatori indipendenti.

Percorso dall'iperciclo catalitico alla selezione molecolareUn iperciclo catalitico chiuso conduce alle equazioni di selezione, a una distribuzione di quasi-specie e alla soglia d'errore, inquadrate dai tre prerequisiti darwiniani.Prerequisiti darwinianicondizioni al contorno per la selezione molecolareMetabolismoAutoriproduzioneMutabilità1Ipercicloaccoppiamento catalitico ciclicoABCDcross-catalisicrescita di secondo grado o superioreauto-organizzazione collettiva2Equazioni di selezioneorganizzazione complessiva costantedxᵢ/dt = xᵢ(Wᵢᵢ − E(t))Wᵢᵢ = valore selettivoE(t) = produttività in eccesso mediaWᵢᵢ > E(t): la frequenza aumentaWᵢᵢ < E(t): la frequenza diminuisceconfronto relativo con E(t)non una corsa alla crescita assoluta3Quasi-specieequilibrio mutazione-selezionesequenza masternube mutante organizzatatipo selvatico = centro della nube4Soglia d'errorelimite informativotasso di mutazionelocalizzatadelocalizzatala quasi-specie si delocalizzaperdita di informazione replicabileciclo catalitico → equazioni di selezione → quasi-specie → soglia d'erroredall'auto-organizzazione molecolare al tetto informativo dell'evoluzione darwiniana

Tre organizzazioni di crescita

  • Crescita catalitica semplice: un catalizzatore esterno promuove la replicazione di uno stampo, ma il catalizzatore stesso non è prodotto dallo stesso ciclo. La legge di crescita non è auto-amplificante.
  • Crescita autocatalitica: una molecola catalizza la propria replicazione o quella delle molecole dello stesso tipo. Il tasso di crescita contiene un termine proporzionale alla prima potenza della concentrazione del replicatore—auto-amplificazione di primo grado.
  • Crescita iperciclica: la replicazione è organizzata come un ciclo chiuso A → B → C → ... → A. Poiché ogni membro è prodotto sotto la catalisi di un altro membro, la crescita complessiva dipende da prodotti di almeno due concentrazioni. Ecco perché gli ipercicli catalitici sono sistemi di secondo grado o superiore.

La distinzione è importante perché solo l'organizzazione iperciclica accoppia l'autoreplicazione a una dinamica collettiva e non lineare in grado di sostenere la selezione a livello molecolare.

Prerequisiti darwiniani

Affinché avvenga la selezione molecolare, devono essere soddisfatte tre condizioni:

  • Metabolismo: una fonte di energia libera e di materiale per mantenere lo stato organizzato lontano dall'equilibrio.
  • Autoriproduzione: la capacità delle unità di moltiplicarsi, affinché le varianti vantaggiose possano aumentare di numero.
  • Mutabilità: variazione ereditabile, senza la quale non esiste substrato per la selezione.

Questi tre prerequisiti sono condizioni al contorno: di per sé non specificano la dinamica quantitativa, ma definiscono il dominio in cui una descrizione darwiniana è significativa.

Equazioni di selezione in organizzazione complessiva costante

Quando la concentrazione totale dei replicatori è mantenuta costante, le frequenze cambiano secondo un'equazione di selezione della forma

( Wii − E(t) ).

Qui Wii è il valore selettivo del tipo di replicatore i, che incorpora i suoi tassi di replicazione e degradazione. E(t) è il produttività in eccesso media, la media ponderata sulla popolazione dei valori selettivi. Un tipo aumenta in frequenza quando il suo W_ii supera E(t) e diminuisce quando scende al di sotto di E(t). La condizione di organizzazione costante rende la selezione un confronto relativo anziché una corsa alla crescita assoluta.

Equilibrio mutazione-selezione e la quasi-specie

La replicazione reale è soggetta a errori. L'equilibrio mutazione-selezione non produce un'unica sequenza di tipo selvatico dominante; genera invece una quasi-specie, una distribuzione organizzata di sequenze mutanti centrata su una sequenza master. Il tipo selvatico è quindi il membro più probabile di una nube di sequenze correlate, non l'unico bersaglio della selezione. La distribuzione è stabile quando il vantaggio selettivo della sequenza master bilancia il flusso mutazionale che se ne allontana.

La soglia d'errore

La quasi-specie può persistere solo se il tasso di mutazione per replicazione è sufficientemente basso. Oltre la soglia d'errore, la sequenza master non può trasmettere affidabilmente la propria informazione, la nube mutante si delocalizza e la distribuzione organizzata collassa in uno stato mutazionalmente randomizzato. Ciò limita quanta informazione un iperciclo o una quasi-specie possono mantenere in modo riproducibile. Il percorso iniziale—ciclo catalitico → equazioni di selezione → quasi-specie → soglia d'errore—collega così l'auto-organizzazione molecolare al tetto informativo fondamentale dell'evoluzione darwiniana a livello molecolare.

Condizione al contorno
Metabolismo, autoriproduzione e mutabilità sono prerequisiti, non etichette opzionali. Se ne manca uno, le equazioni di selezione perdono la loro interpretazione darwiniana, anche se il ciclo chimico continua a girare.