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Il gioco dell'evoluzione delle frasi e la soglia d'errore
HYC-1979Lesson 3: Error Threshold and Early Replicative Units
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Nel gioco dell'evoluzione delle frasi, una frase di senso compiuto rappresenta un biopolimero funzionale. Il suo significato dipende dall'ordine esatto delle lettere, quindi gli errori di copiatura agiscono come mutazioni che di solito distruggono la funzione. Supponiamo che la frase abbia lunghezza ν e che q sia la fedeltà di copiatura per lettera. La probabilità che una copia completa sia priva di errori è . Aumentare la lunghezza o ridurre la fedeltà rende quindi la trasmissione accurata esponenzialmente meno probabile.

La selezione entra in gioco attraverso il vantaggio selettivo σ: l'idoneità della frase di senso compiuto rispetto alla sua nube di mutanti. Per le molecole, σ è il tasso più elevato di replicazione, catalisi o sopravvivenza della sequenza corretta rispetto ai suoi mutanti. Il gioco chiede se la selezione può mantenere la sequenza di senso compiuto attraverso le generazioni o se i mutanti prendono il sopravvento.

La condizione di soglia d'errore per un'informazione stabile è . Per piccoli tassi d'errore per lettera (1 − q), questa è approssimativamente . Se la disuguaglianza non è soddisfatta, la popolazione subisce una catastrofe d'errore: si delocalizza allontanandosi dalla sequenza funzionale e si dissolve in una nube di mutanti.

La soglia d'errore e il destino di una frase di senso compiutoqν σ > 1 preserva la frase maestro; qν σ < 1 causa la catastrofe d'erroreq = fedeltà per letteraν = lunghezza della fraseσ = vantaggio selettivoSopra la soglia: qν σ > 1Sotto la soglia: qν σ < 1Sequenza maestrosignificato intattoCopia di senso compiutoCopia di senso compiutoCopia di senso compiutoCopia di senso compiutoCopia di senso compiutoCopia di senso compiutoMessaggio preservatoLa nube di mutanti rimane piccola.MutanteMutanteMutantenube di mutantiCatastrofe d'erroreIl messaggio si dissolve in una nube di mutanti.Sequenza maestrosignificato intatto

Esempio svolto

Se una frase di senso compiuto ha lettere, , e , allora . Il messaggio è sotto la soglia e va perduto. Accorciando a si ottiene , quindi la frase di senso compiuto può essere mantenuta.

Ipotesi e perfezionamenti

Il gioco di base presuppone errori uniformi e indipendenti, una singola sequenza maestro, un'organizzazione costante e un significato del tipo tutto-o-niente. Reti neutre, ricombinazione, compartimentazione e accoppiamento iperciclico possono modificare la soglia effettiva. Aumentare σ estende la lunghezza sostenibile solo in modo logaritmico, quindi un'alta fedeltà è essenziale per i genomi lunghi.

Obiettivo di apprendimento
Spiegare come il gioco dell'evoluzione delle frasi verifica la soglia d'errore per un'informazione stabile.
Nota supplementare
Il gioco collega la soglia d'errore astratta delle quasi-specie ai limiti d'informazione molecolare. Fornisce inoltre un vincolo che l'organizzazione iperciclica deve rispettare o mitigare.