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翻訳を伴うハイパーサイクル:共役した複製とポリペプチド合成
HYC-1979Lesson 6: Concentration, Hypercycles, Fixed
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翻訳共役ハイパーサイクル は、すべてのポリヌクレオチドを 複製鋳型 と 翻訳鋳型の両方として機能させることで、基本ハイパーサイクルを拡張したものである。同一のRNA分子がレプリカーゼによって複製され、リボソームによって読み取られるため、複製と翻訳は 競合する 、鋳型を巡って。

翻訳を伴うハイパーサイクルRNAi は複製鋳型と翻訳鋳型の両方であり、2つの過程が同一分子を巡って競合するRNAi−1二重鋳型RNAi二重鋳型RNAi+1二重鋳型Ei−1触媒Ei触媒Ei+1触媒翻訳翻訳翻訳触媒複製触媒複製Ei+1 がRNAの複製を触媒するi−1、サイクルを閉じる二重鋳型RNAi は複製され翻訳される→ 競合する1翻訳RNAi → Ei2複合体形成Ei + RNAi+1 ⇌ (RNAi+1·Ei)3触媒複製(RNAi+1·Ei) → 2 RNAi+1 + Ei

分子的・速度論的構造

  • 二重鋳型の役割。 メンバー i において、RNAi は複製されてより多くのRNAを産生しi 、翻訳されてポリペプチドを産生する 。2つの過程は同じ遊離RNAプールを利用するi。
  • サイクルの閉鎖。 メンバー i から翻訳されたポリペプチドは、通常 i+1 である別のメンバーの複製を触媒する。この組織は純粋な自己触媒ではなくハイパーサイクル的である。なぜなら は自身の鋳型RNAを触媒しないためであるi。
  • 共役する化学種。 速度論的状態には、遊離ポリヌクレオチド、遊離ポリペプチド、およびポリヌクレオチド–ポリペプチド複合体が明示的に含まれる。複合体は触媒活性型または複製活性型であり得る。例えばRNAi+1·。
  • 速度論的構造。 鋳型依存的な複製と翻訳は、触媒フィードバックと相互に連結している。ポリペプチドの情報は、それをコードするポリヌクレオチド鋳型を通じてのみ維持され、ポリペプチド自体は独立して複製されない。
  • システムレベルの帰結。 翻訳共役ハイパーサイクルは、複製サイクルに翻訳と複合体形成のステップを追加するため、単純な触媒ハイパーサイクルに還元することはできない。これらの追加ステップは、後の濃度限界と安定性の解析の基盤となる。

基本的な速度論的ステップ

サイクルメンバー i について、簡潔なスキームは次のとおりである:

  • 翻訳:RNAi → RNAi + 。
  • 複合体形成: + RNAi+1 ⇌ (RNAi+1·)。
  • 触媒複製:(RNAi+1·) → 2 RNAi+1 + 、または + RNAi+1 → 2 RNAi+1 + (複合体が明示的に示されていない場合)。

RNAの複製はi はEによって触媒されるi−1。i について繰り返すことで、翻訳共役ハイパーサイクルが閉じる。複製と翻訳は同じRNA鋳型を共有するため、それらの相対速度が、複製に使われるRNAの量と触媒として利用可能なポリペプチドの量を決定する。この共役が、基本ハイパーサイクルとの決定的な構造的違いである。

学習目標
ポリヌクレオチド–ポリペプチドの共役と複合体形成を含む、翻訳を伴うハイパーサイクルの構造と速度論的仮定を説明する。