통합 세포는 별개의 생명 기원이 아니라, 분자 자기 조직화가 연속적·단계적으로 확장된 끝점이다. 각 단계는 특정한 정보·촉매·기생 문제를 해결하며, 그 과정에서 다윈적 선택은 분자 수준에서 계속 작동한다.

• 1단계 — 생명 이전 원료: 생명 이전 합성은 비무작위적 존재량으로 아미노산과 폴리뉴클레오타이드를 만들어내며, GC가 풍부한 복제와 같은 조성 편향이 최초의 복제자들을 제약한다.
• 2단계 — 유사종: 돌연변이와 선택은 유사종 집단을 형성하며, 이 집단이 유지할 수 있는 안정적인 정보량은 복제 충실도와 오류 임계값에 의해 제한된다. q̄m, σm, vm은 정보의 소실 또는 유지를 예측한다.
• 3단계 — 초순환적 통합: 촉매적·자기촉매적·초순환적 결합은 복제자들을 일관된 성장을 보이는 협력적 순환으로 연결한다. 기생자, 돌연변이 부하, 핵 생성 실패가 초순환 조직의 한계를 규정한다.
• 4단계 — 번역과 원시 암호화: RNA 어댑터/전령, 쉼표 없는 프레임, 초기의 GGC/GCC 코돈, 리보솜이 필요 없는 펩타이드 전달은 초순환을 암호화된 기능성 폴리펩타이드로 확장한다.
• 5단계 — 구획화: 구획화된 초순환과 원시 세포는 결합된 복제와 번역을 국소화하고, 기생적 착취를 억제하며, 현실적인 경계 조건에서 더 높은 수준의 선택 단위를 만든다.
• 6단계 — 유전체 통합: 여러 초순환적 복제자가 하나의 통합 유전체로 결합된다. DNA 교정, 재조합, 향상된 충실도는 오류 임계값을 이동시켜 더 큰 통합 세포를 가능하게 한다.

연속성 원리: 이러한 전환은 별개의 기원이 아니라 촉매적 폐쇄, 정보 용량, 구조적 통합이 연속적으로 증가하는 과정이다. 오류 대재앙, 기생적 착취, 공동 기능 실패와 같은 실패 양상은 이후 단계가 반드시 극복해야 할 경계를 표시한다.

선택 이론과의 형식적 종합: 고정점 및 야코비안 분석, 극한 순환, 호프 분기, 결합 양상은 통합이 언제 안정적이고 언제 붕괴하는지를 설명한다. Qβ 파지 돌연변이 유발은 돌연변이 분포와 오류 임계값을 보여주며, 문장 진화 게임은 충실도가 정보를 어떻게 제한하는지 보여준다. 이후 DNA 교정과 재조합이 이 한계를 완화하여, 초기의 RNA/단백질 초순환에서 통합 유전체가 어떻게 출현할 수 있었는지 설명하는 데 도움을 준다.