A organização hipercídica integra replicadores de outro modo competitivos por meio de um fechamento catalítico, mas permanece vulnerável à exploração parasitaria e aos limites de erro-limiar e de informação. O acoplamento catalítico de ordem superior — hiperciclos que catalisam outros hiperciclos — estende essa organização hierarquicamente, mas também cria novos problemas de integração e de parasitas.
Acoplamento Parasitário
A parasita recebe apoio catalítico de um ou mais membros do hiperciclo sem contribuir para o ciclo catalítico do hiperciclo. Ele explora o ciclo sem devolver auxílio catalítico. Para um parasita autorreprodutor A competindo com um membro do hiperciclo x a concentração total constante
ċₐ = kₐ cₐ² − (cₐ/c0)(kₐ cₐ² + k cₐ x)
O sistema tem dois pontos fixos nos vértices do simplex de concentração S2: dominância do parasita (cₐ = c0,
Problema de Integração
A ligação direta em uma única grande unidade replicativa é proibitiva devido à relação de limiar para vₘₐₓ. As unidades integradas devem permanecer competitivas em relação aos seus próprios mutantes para evoluir mais e evitar perder suas informações específicas. A questão de integração colocada pergunta: “Como se pode conceber uma integração de moléculas competitivas, que não seja pela ligação em uma única grande unidade replicativa, a qual é proibitiva devido à relação de limiar para vₘₐₓ? (Observe que as unidades a serem integradas devem permanecer competitivas em relação aos seus mutantes para evoluir mais e não perder suas informações específicas.)”
As vias possíveis incluem:
- Acoplamento funcional: as moléculas cooperam cataliticamente sem fusão covalente.
- Compartimentalização: os componentes permanecem juntos em um volume delimitado.
- A organização hipercídica: os concorrentes são integrados por meio de um ciclo catalítico.
Qualquer via deve permitir que as unidades integradas permaneçam competitivas em relação aos seus próprios mutantes.
Por que a Organização Hipercídica de Genes Separados?
Um único genoma grande acumula uma explosão combinatória de sequências mutantes à medida que seu comprimento aumenta. Para 100 sítios, há 100 mutantes de um erro, 4950 mutantes de dois erros, 161 700 mutantes de três erros, e assim por diante. A replicação sem erros torna-se impossível além do limiar de erro. A organização hipercídica distribui a informação e permite a seleção entre módulos mutantes, reduzindo o ônus de manutenção de um único genoma longo.
Limites e Melhorias
Os limites da organização hipercídica incluem suscetibilidade a parasitas, restrições do limiar de erro sobre o conteúdo total de informação e coordenação lenta ou ineficiente entre genes separados. As melhorias ou transições propostas incluem integração estrutural mais estreita, compartimentalização e evolução de um único genoma que assegure a cossegundos regação de genes cooperantes.
Acoplamento Catalítico de Ordem Superior
O acoplamento catalítico de ordem superior ocorre quando hiperciclos catalisam outros hiperciclos. Isso estende a integração além de um único ciclo, mas introduz novos desafios parasitários, de coordenação e de estabilidade. Em hiperciclos acoplados à tradução, acoplar a replicação à síntese de polipeptídeos acrescenta formação de complexos e constantes de associação; os limites de baixa e alta concentração e a cinética saturante modificam as mesmas restrições de integração e de parasitas.
