9
Интеграция без лигирования: функциональное сопряжение
HYC-1979Lesson 1: Eigen, Schuster, Hypercycle
00:00

Любое прежнее ограничение на точность копирования теперь становится ограничением на интеграцию. Поскольку единичная самореплицирующаяся единица способна стабильно поддерживать лишь ограниченный объём информации, объединение конкурирующих молекул в одну длинную слитную репликативную единицу не является доступным путём. Лигирование увеличивает длину последовательности, мутационная нагрузка растёт вместе с длиной, и полученная единица выходит за порог ошибок; пороговое соотношение для vₘₐₓ делает столь длинную единицу нежизнеспособной. Поэтому интеграция, если она вообще должна произойти, должна быть достигнута без ковалентного слияния.

Интеграция без лигированияСлияние в один длинный геном против каталитического сопряжения отдельных единицЛигированиенедопустимоОдна длинная слитная репликативная единицаКонкурирующие репликативные единицылигированиеКовалентно соединены в одну длинную последовательностьБлокируется порогом ошибокДлиннее последовательность → больше мутационная нагрузкаvmax порог превышенИтог: слитная единица теряет свою информациюДлина превышает точность копирования единицыФункциональное сопряжениеальтернативаОтдельные единицы, связанные общими каталитическими продуктамиНековалентная интеграцияПродукт A усиливает BABбез лигированияПродукт B усиливает AКаждый репликатор по-прежнему копируется самостоятельноОбщие продукты создают взаимную зависимостьОтбор действует на сопряжённый ансамбльИнтеграция каталитическая, а не ковалентнаяСопряжённый ансамбль должен превосходить по конкурентоспособности своих мутантов

Почему лигирование не работает

Лигирование нескольких репликаторов в одну молекулу даёт более длинную последовательность, которая должна точно копироваться в каждой позиции. Чем длиннее последовательность, тем больше мутационная нагрузка на одну репликацию, и как только длина превышает то, что способна поддержать точность копирования, единица выходит за пределы области стабильного поддержания информации. Это тот же барьер, который ограничивает любую единичную самореплицирующуюся единицу, теперь применённый к слитному геному: пороговое соотношение для vₘₐₓ исключает ту очень длинную единицу, которую создало бы лигирование.

Функциональное сопряжение: интеграция без слияния

Альтернатива — оставить единицы раздельными и соединить их функционально а не ковалентно. Каждая репликативная единица остаётся индивидуально реплицируемой, но производимые ими каталитические продукты действуют друг на друга, так что репликация каждой усиливается присутствием остальных. Поэтому интеграция принимает форму каталитической сети или цикла, а не единого слитного генома:

  • Лигирование не требуется — последовательности остаются короткими и, следовательно, сохраняются в пределах стабильного поддержания информации.
  • Общие каталитические продукты — продукты одной единицы служат катализаторами для репликации другой, создавая взаимную зависимость.
  • Нековалентная интеграция — связь является каталитической и динамической, а не новой химической связью между последовательностями.

Каталитический цикл как простейший пример

Рассмотрим два репликатора, A и B. Каталитический продукт A усиливает репликацию B, а каталитический продукт B усиливает репликацию A. A и B никогда не лигируются в один геном, однако их общие каталитические продукты сопрягают их в интегрированную функциональную единицу. Поскольку каждая единица по-прежнему копируется самостоятельно, цикл не наследует штраф за длину, который несёт слитный геном A–B.

Сопряжённый ансамбль как единица отбора

Как только единицы сопрягаются таким образом, отбор больше не проверяет единичную длинную последовательность. Он проверяет весь сопряжённый ансамбль. Это создаёт дополнительное требование: интегрированная система должна оставаться конкурентоспособной по отношению к своим собственным мутантам. Если возникают мутантные субъединицы, которые отказываются от кооперации и реплицируются быстрее сами по себе, они распространятся, и сопряжённая система потеряет свою специфическую информацию. Поэтому функциональная интеграция сохраняется лишь тогда, когда ансамбль в целом превосходит по конкурентоспособности своих мутантов — и именно эта конкурентоспособность позволяет сопряжённой системе эволюционировать дальше.

Распространённое заблуждение
Функциональное сопряжение — это не свободная или случайная ассоциация. Общие каталитические продукты должны давать сопряжённому ансамблю селективное преимущество перед его мутантами; в противном случае кооперация будет захвачена, и специфическая информация, переносимая единицами, будет утрачена.