Lý thuyết siêu chu trình đưa ra ba luận điểm trung tâm, cùng nhau làm rõ cách quá trình sao chép phân tử có thể được tích hợp với chọn lọc Darwin. Các luận điểm đi từ những tiền đề phân tử của chọn lọc, đến các yêu cầu đối với động lực học Darwin, cho tới tổ chức bậc cao liên kết các đơn vị tự sao chép.

Luận điểm 1 — Cơ sở phân tử được xác định rõ

Chọn lọc và tiến hóa không phải là thuộc tính toàn cục của bất kỳ dạng vật chất tùy ý nào. Chúng là hệ quả của những đặc tính lý hóa đặc thù, có thể xác định rõ. Theo luận điểm này, một hệ chỉ có thể được coi là trải qua chọn lọc khi các phân tử cấu thành nó sở hữu những đặc điểm cụ thể về động học, nhiệt động học và cấu trúc cho phép sao chép khác biệt. Việc viện dẫn tới vật chất hay tự tổ chức một cách trừu tượng là không đủ; cơ chế phải được xác định rõ.

Luận điểm 2 — Các yêu cầu đối với chọn lọc Darwin

Chọn lọc Darwin đòi hỏi ba năng lực được thể hiện ở cấp độ phân tử: tự sinh sản, đột biến, và một cơ sở vật lý cho sự di truyền. Tự sinh sản cung cấp sự liên tục của dòng dõi; đột biến cung cấp sự biến dị; và một cơ chế di truyền vật lý đảm bảo rằng những cấu trúc phân tử đã biến đổi được truyền lại cho các thế hệ sau. Nếu thiếu cả ba, một quá trình có thể biến đổi theo thời gian nhưng không cấu thành chọn lọc Darwin.

Luận điểm 3 — Tổ chức siêu chu trình

Lý thuyết siêu chu trình đề xuất sự tích hợp tự tổ chức, mang tính xúc tác và chức năng của các đơn vị tự sao chép. Chính tổ chức bậc cao này là thứ kết nối quá trình sao chép phân tử với chọn lọc Darwin và với tự tổ chức tự nhiên. Một đơn vị sao chép đơn lẻ bị hạn chế bởi độ chính xác sao chép hữu hạn và một ngưỡng sai số; tổ chức siêu chu trình mở ra cách để nhiều thực thể sao chép được giữ lại và ghép nối, nhờ đó tập thể có thể duy trì và tiến hóa nhiều thông tin hơn so với một đơn vị đơn lẻ.

Sự phụ thuộc lẫn nhau và các ràng buộc

Ba luận điểm phụ thuộc lẫn nhau. Luận điểm 2 xác định các yêu cầu phân tử đối với chọn lọc, trong khi Luận điểm 3 đề cập đến cách các đơn vị này có thể được tổ chức vượt ra ngoài những đơn vị sao chép đơn lẻ. Độ chính xác sao chép và các ngưỡng sai số đóng vai trò ràng buộc liên kết các luận điểm: chúng quyết định lượng thông tin mà một đơn vị sao chép đơn lẻ có thể duy trì, và do đó thúc đẩy sự tích hợp. Mỗi luận điểm phải được gắn với một cơ chế phân tử hoặc lý hóa cụ thể; việc chỉ viện dẫn tới tự tổ chức hay vật chất là không thỏa mãn lý thuyết.