2
Sự tăng trưởng xúc tác, tự xúc tác và siêu chu trình
HYC-1979Lesson 2: Catalytic, Which, System
00:00

Các kiểu tăng trưởng trong những hệ phân tử tự sao chép được phân biệt bởi hai yếu tố cùng lúc: bậc động học và cấu trúc liên kết mạng lưới liên kết các loài tham gia phản ứng. Với cùng nguồn cung cơ chất và cùng hằng số tốc độ, ba chế độ xuất hiện - xúc tác thông thường (tuyến tính), tự xúc tác (hàm mũ) và tăng trưởng siêu chu trình (bậc hai hoặc cao hơn, mang tính hợp tác).

Sự tăng trưởng xúc tác, tự xúc tác và siêu chu trìnhbậc động học × cấu trúc liên kết mạng lướiAXúc tác tuyến tínhsản phẩm không tự hỗ trợ chính nóC (hằng số)SP[P]thời gian ttuyến tínhd[P]/dt ≈ hằng số[P] tăng tuyến tính theo thời giankhông có thừa số [P] trong số hạng tăng trưởngBTự xúc táctự khuếch đại bậc nhấtX xúc tác cho chính sự hình thành của nóS + X → 2X[X]thời gian thàm mũd[X]/dt = k[S][X]tăng trưởng theo hàm mũ thời gianbậc nhất theo chất tự sao chépCSiêu chu trìnhmột vòng xúc tác khép kíncác liên kết xúc tác phải khép lại thành một chu trìnhI₁ → I₂ → I₃ → I₁I₁I₂I₃khép kínchu trìnhsinh sản ∝ xi·xi-1mỗi đơn vị được xúc tác bởi đơn vị đứng trước nóbậc hai · vòng hoạt động như một đơn vị

1 · Tăng trưởng xúc tác thông thường: sản phẩm không tự hỗ trợ chính nó

Một chất xúc tác C làm trung gian cho phản ứng S → P. Khi [C] được giữ không đổi - enzyme được đệm, nguồn cung ổn định, hay bề mặt khoáng - tốc độ d[P]/dt ≈ k[C][S] vẫn không đổi chừng nào S chưa cạn kiệt, nên sản phẩm tích lũy một cách tuyến tính theo thời gian. Không có gì trong sơ đồ khiến P xúc tác cho chính sự hình thành của nó: số hạng tăng trưởng không chứa thừa số [P], và phản ứng không được liên kết với bất kỳ mạng lưới rộng hơn nào.

2 · Tăng trưởng tự xúc tác: tự khuếch đại bậc nhất

Trong S + X → 2X, khuôn mẫu X được tái tạo thành sản phẩm, nên X xúc tác cho chính sự hình thành của nó. Khi cơ chất được đệm, d[X]/dt = k[S][X] và nghiệm là hàm mũ, k[S]t. Số hạng tăng trưởng là bậc nhất theo chính chất tự sao chép. Đây đã là một dạng chọn lọc, nhưng mỗi chất tự xúc tác cạnh tranh một mình, vì sự tăng trưởng của nó chỉ phụ thuộc vào nồng độ của chính nó.

3 · Tăng trưởng siêu chu trình: một vòng xúc tác khép kín

Tăng trưởng siêu chu trình xuất hiện khi các đơn vị tự sao chép I1, I2, ..., được kết nối thành một chu trình xúc tác khép kín: trong cách đánh chỉ số theo chu trình, đơn vị được xúc tác bởi đơn vị đứng trước nó Ii-1. Do đó, số hạng sinh sản của thành viên i tỉ lệ với [][Ii-1], điều này gắn kết tự sao chép với xúc tác chéo. Một siêu chu trình hai thành viên là trường hợp nhỏ nhất: I1 xúc tác cho I2 và I2 xúc tác cho I1, nên cả hai số hạng tăng trưởng đều tỉ lệ với [I1][I2].

Hai tiêu chí nhận diện một siêu chu trình

  • Tiêu chí mạng lưới. Một siêu chu trình không phải là hỗn hợp của các chất tự xúc tác độc lập. Các liên kết xúc tác của nó phải khép lại thành một chu trình, nên sự tăng trưởng và chọn lọc tác động lên vòng được gắn kết như một đơn vị duy nhất.
  • Tiêu chí bậc. Các siêu chu trình xúc tác là những hệ bậc hai hoặc cao hơn, vì số hạng sinh sản của chúng chứa tích của ít nhất hai biến nồng độ, chẳng hạn xixi-1. Các số hạng bậc cao hơn có thể phát sinh từ sự hình thành phức hợp, sự sao chép gắn với dịch mã, hoặc động học bão hòa.

Hệ quả đối với chọn lọc

Tăng trưởng siêu chu trình mang tính hợp tác và phi tuyến. Nó không thể được quy giản thành các đối thủ cạnh tranh hàm mũ độc lập, vì vận mệnh của mỗi thành viên gắn với đơn vị đứng trước nó trong chu trình: việc loại bỏ, làm chậm, hay lợi dụng một đơn vị sẽ thay đổi sự tăng trưởng của toàn bộ vòng. Đó chính là lý do siêu chu trình báo trước những câu hỏi về sau liên quan đến tích hợp, ổn định và thách thức ký sinh.

Nhầm lẫn thường gặp
Hai chất tự xúc tác nằm trong cùng một ống nghiệm không phải là một siêu chu trình. Tăng trưởng hàm mũ là bậc nhất theo một loài, trong khi một siêu chu trình cần một chu trình khép kín gồm các liên kết xúc tác và tạo ra các số hạng sinh sản bậc hai hoặc cao hơn, chẳng hạn xixi-1.