超循环理论 提出了三大核心命题，共同阐明了分子复制如何与达尔文选择相整合。这三大命题依次从选择的分子前提，推进到达尔文动力学的要求，再延伸到连接自我复制单元的高阶组织。

命题 1——特定的分子基础

选择与进化并非任何任意物质形态的全局属性，而是特定且可被明确界定的物理化学性质的产物。根据本命题，只有当系统的组成分子具备具体的动力学、热力学和结构特征，从而允许差异化复制时，该系统才可被视为经历了选择。笼统地诉诸 物质 或 自组织 是不够的；必须识别出具体机制。

命题 2——达尔文选择的要求

达尔文选择需要三种在分子层面得以实现的能力： 自我繁殖、 突变以及 遗传的物理基础。自我繁殖提供谱系连续性；突变提供变异；物理遗传机制确保改变后的分子结构被传递给后代。若三者缺一，过程虽可随时间变化，却不构成达尔文选择。

命题 3——超循环组织

超循环理论提出，自我复制单元通过自组织的、催化的和功能性的方式实现整合。正是这种高阶组织将分子复制与达尔文选择及自然自组织联系起来。孤立的复制体受限于有限的复制保真度和误差阈值；超循环组织为若干复制实体提供了一种得以保留并耦合的途径，使集体能够维持并演化比单一单元更多的信息。

相互依赖与约束

三大命题相互依赖。命题 2 阐明了选择的分子要求，而命题 3 论述了这些单元如何超越孤立复制体实现组织。复制保真度与误差阈值作为约束将各命题联系起来：它们决定了单个复制单元能够维持多少信息，从而推动了整合的需要。每个命题都必须给出具体的分子或物理化学机制；仅仅援引 自组织 或 物质 并不能满足该理论的要求。