当早期复制体接近误差阈值时，一类全新的分子出现了，它们能够将 RNA 编码的信息与催化功能联系起来： 短小的低特异性肽。这些最早的具有功能的活性蛋白质并非现代具有折叠结构的酶。它们由有限的前生命时期氨基酸"字母表"构成，仅依靠少数主链和侧链基团形成一个原始的催化口袋。

是什么让它们具有功能活性？

• 简单的结构：早期蛋白质可能由短肽或小分子蛋白质构成，仅使用有限的氨基酸集合。它们的催化活性源于少数主链和侧链基团共同形成的原始口袋。
• 被选择的功能：它们可能的功能是通过催化合成反应——如核苷酸活化、聚合或肽键形成——来支持复制，并反作用于复制循环。
• 催化闭合：在超循环或翻译偶联的环境中，由一个成员编码的产物可以增强其他成员的合成或复制，从而将 RNA 信息与蛋白质催化联系起来。
• 过渡性催化剂：低保真度的翻译和复制限制了肽的长度和催化精度。在更好的校对和翻译机制进化出现之前，只有低特异性的原初酶能够被维持。这些蛋白质代表着从 RNA 催化向蛋白质催化的过渡——而非现代折叠酶的突然出现。