一个 自催化复制子 可以从单个模板拷贝起步：只要有一个分子存在，它就能指导自身的合成并实现扩增。而 超循环 则不同。它是一个由相互依赖的复制子构成的闭合循环：每个成员都通过另一个成员的催化活性获得扩增或支持，而 闭合性 至关重要。这就产生了 成核问题。

由于超循环要求循环中的每一个成员都存在并建立功能上的连接，因此单个突变基因——即使具有催化活性——也无法建立超循环。循环仍处于开放状态。孤立的复制或催化并不能形成定义超循环的相互依赖网络。

随机性与组合性障碍

成核还需要 足够的初始量 循环的所有成员。否则，随机丢失、稀释和分解会在闭合循环的增长速度超过其组成部分衰变速度之前，就清除了这些组分。因此，从单一复制子到超循环的转变具有阈值特性或协同性：不完整的循环和不完整的集合可能无法表现出超循环增长。

突变体组合学使起步更加困难。对于长度为 的序列，k-错突变体的数量为 。由此得到 100 个一错突变体、4,950 个二错突变体、161,700 个三错突变体，依此类推。如果超循环必须组装 n 个相容的成员，则可能的集合数量约为 适用于 。因此，寻找一个协调的闭合集合的搜索空间极其巨大，远大于寻找单个有利突变体。

基于这些原因，超循环更可能是通过突变和选择，从富含 GC 的准物种逐步成核而来，而非从单个模板或单个突变基因从头组装而成。