一個 酵素週轉 循環、一個 模板導向的 RNA 複製 循環，以及 半保留式 DNA 複製 是三種超循環理論絕不可混為一談的分子模式。關鍵的區別在於一個過程僅是轉化受質，還是同時複製序列資訊。只有模板複製才能創造出可遺傳的單位，使其受到突變、選擇，以及形塑超循環組織的誤差閾值限制。

應加以區分的三種角色：催化劑、模板、產物

酵素週轉。 酵素加速受質轉化為產物，隨後原樣釋出，既不被消耗也不被複製。酵素不具模板角色。它能放大產物，卻不會複製催化劑自身的分子資訊。就超循環而言，單憑催化作用無法成為達爾文單位，因為它不攜帶可遺傳的序列。

RNA 複製。 RNA 複製是模板導向的合成：一條 RNA 股引導互補 RNA 股的形成。在正／負股複製循環中，互補股可作為模板再生原始股，因此互補配對可作為自催化單位運作，儘管單一 RNA 股是模板而非週轉催化劑。被複製的序列即是可遺傳的資訊。

DNA 複製。 DNA 複製是半保留式模板複製：雙股分離，每條親代股作為新互補股的模板。每個子代雙股皆含一條舊股與一條新股。此複製之所以稱為半保留式，是因為兩個子代皆非完全由新材料構成；各自保留了一條親代股。

比較表

這對超循環為何重要

單憑催化作用無法成為達爾文單位，因為它不攜帶可遺傳的序列。自催化與模板複製系統提供了誤差閾值與超循環論證所需的自我複製與可突變性。超循環整合了自我複製實體；因此，週轉與複製之間的區分至關根本。此比較區分出三種角色：催化劑、模板與產物。酵素週轉放大產物而不複製催化劑；RNA 複製透過互補中間物放大序列；DNA 複製則以半保留方式複製雙股。