原始遺傳密碼如何從由兩個密碼子組成的原始密碼，逐步發展為主要胺基酸字母表？本投影片將密碼的擴展視為一個 受約束的逐步過程，而非一舉躍升至完整的 64 個密碼子表。起始點是 GGC 與 GCC這一對密碼子，它們先前因富含 G–C 的複製、高保真度，以及具連貫性的無逗號閱讀框而被選中。第一次擴展加入了 GAC 與 GUC，將 天門冬胺酸（Asp） 與 纈胺酸（Val） 指派至早期密碼中。按標準對應：GGC → Gly、GCC → Ala、GAC → Asp、GUC → Val。

為何此擴展在組合上很簡單

所有四個早期密碼子共享一個固定框架： 5′ G ... 3′ C。只有 第二位置 會變動——它會取樣 G、C、A 與 U。這提供了一條精簡的組合路徑：一旦 G–C 框架及其複製保真度確立，便可透過改變單一位置來探索新的指派。因此，在一個已足夠穩固的框架內，擴展至 GAC 與 GUC 是自然而然的下一步。

什麼限制了主要字母表

並非每種胺基酸都能加入。主要集合受到 前生命時期豐度 與 結構性標準的限制：只有足夠常見、具有合適側鏈化學性質，並能與 RNA 銜接子相容、可進行活化與肽鏈轉移的胺基酸，才能進入密碼。一個合理的轉譯起源也需要大小如 tRNA、可重複製造的 RNA 分子，能夠作為雙重銜接子與訊息傳遞者，加上原始的肽鏈轉移機制，以及足以維持指派關係的保真度。

與超循環的耦合

密碼擴展是一個耦合的分子選擇問題。新的密碼子必須能改善與轉譯耦合的超循環，或至少不會使其不穩定，而整個系統必須維持在誤差閾值範圍內。本投影片是從最初兩個密碼子通往主要字母表的橋樑；它尚未涵蓋完整的後續密碼子指派表，或轉譯的完整合成過程。